Sendo um dos militares responsáveis pelo Golpe de Estado de 25 de Abril de 1974, Marques Júnior foi um dos denominados “Capitães de Abril”, esteve ligado ao Movimento das Forças Armadas (MFA) e foi membro do Conselho da Revolução. Posteriormente foi deputado à Assembleia da República por mais de um quarto de século, primeiro pelo PRD e depois pelo PS – Partido Socialista.
António Alves Marques Júnior nasceu a 3 de Julho de 1946. Licenciou-se em Ciências Militares e era Coronel de Infantaria do Exército. Foi membro do MFA (Movimento das Forças Armadas) e do Conselho de Revolução, enquanto este existiu (1975-1982).
Marques Júnior foi deputado à Assembleia da República, entre 1985 e 2011 em oito legislaturas, tendo chegado a ser Vice-presidente deste parlamento. Dirigente do Partido Renovador Democrático (PRD) foi eleito nas listas deste partido pelo Círculo Eleitoral de Setúbal em duas legislaturas (IV e V, 1985-1991).
Passaria a ser eleito nas listas do Partido Socialista (PS), em 1991 (VI Legislatura) por Lisboa, em 1995, 1999 e 2002 (VII, VIII e IX) por Viana do Castelo e, finalmente, em 2005 e 2009 (X e XI) pelo Porto. Dentro do PS, chegou a ser membro da Comissão Política e Nacional. À data da sua morte era presidente do Conselho de Fiscalização do Sistema de Informações.
Marques Júnior faleceu com 66 anos, a 31 de Dezembro de 2012, no Hospital de São Francisco Xavier, em Lisboa, onde esteve internado desde dia 26, vitima de derrame cerebral.
Depois de prestadas homenagens na Academia Militar e na Basílica da Estrela, em Lisboa, os seus restos mortais foram colocados no jazigo da sua família, em São Martinho de Bornes, Pedras Salgadas uma paróquia da freguesia de Bornes de Aguiar, concelho de Vila Pouca de Aguiar, distrito de Vila Real.
Foi homenageado Grã-Cruz da Ordem da Liberdade (15 de Novembro de 1982) e Comendador da Ordem do Mérito da Costa do Marfim (20 de Março de 1991)
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